二代基因测序(next generation sequencing, NGS)又称为高通量测序,该技术能够同时对上百万甚至数十亿个DNA进行分析,实现了高通量测序的目标。目前国外已发表了多个NGS检测技术指南,包括《二代测序诊断指南》、《基于二代测序的肿瘤panels验证指南》等。我国近年来也发表了多个NGS专家共识,包括《临床分子病理实验室二代基因测序检测专家共识》、《临床基因检测报告规范与基因检测行业共识探讨》、《二代测序技术在肿瘤精准医学诊断中的应用专家共识》、《二代测序技术在血液肿瘤中的应用中国专家共识(2018年版)》等。
然而,现有指南通常侧重检验科室的技术参数标准,尚缺乏可指导NGS检测在实体瘤临床诊疗路径中应用的指南或共识。我国非小细胞肺癌(NSCLC)患者数量庞大,精准治疗药物的可及性高,全面而准确的肿瘤基因诊断结果已经成为肺癌医师临床诊疗的刚需。2020年9月,《二代测序技术在NSCLC中的临床应用中国专家共识(2020版)》于中国肺癌杂志正式发布,旨在为我国NSCLC临床诊疗规范使用NGS这一新型基因检测技术提供指引。
常规推荐进行NGS检测的NSCLC患者
推荐所有病理诊断为肺腺癌、含有腺癌成分的肺癌以及不能分型的晚期新发或术后复发的NSCLC患者常规进行基因检测。【I级推荐】对经小标本活检诊断为含有腺癌成分或具有腺癌分化的混合型鳞癌,以及年轻或不吸烟/少吸烟肺鳞癌患者,也推荐进行基因检测。【II级推荐】针对敏感型突变发生率高的NSCLC患者(见“共识1”),常规基因检测结果为阴性时,建议使用中国国家药品监督管理局(National Medical Products Administration, NMPA)或美国食品药品监督管理局(Food and Drug Administration, FDA)批准的NGS产品进行复检。【III级推荐】晚期新发或术后复发NSCLC患者首次进行基因检测的目标范围推荐针对晚期新发或术后复发的NSCLC患者,首次检测建议采用NMPA批准的检测产品,检测至少包括NSCLC常见驱动基因: EGFR突变(应涵盖18号、19号、20号、21号外显子),以及ALK融合、ROS1融合。【I级推荐】
针对晚期新发或术后复发的NSCLC患者,结合患者实际临床情况,如需获得更多的潜在靶点信息,首次检测建议采用NMPA或FDA批准的检测产品,检测包括BRAF V600E、KRAS(如G12C等)、NTRK1/2/3融合、MET 14号外显子跳跃突变和MET扩增、ERBB2 20号外显子插入、RET融合等少见驱动基因变异。【II级推荐】
共识3和共识4中基因检测均为阴性的NSCLC患者再次检测时,建议采用NMPA或FDA批准的NGS产品,检测包含EGFR罕见变异形式(包括激酶区重复和融合)、BRAF罕见变异形式(包括激酶区重复和融合)、MET罕见变异形式(包括激酶区重复和融合)、ERBB2融合等罕见变异形式。【III级推荐】结合患者实际临床情况,如需获取免疫治疗相关的分子标志物信息,晚期新发或术后复发的NSCLC患者,建议采用NMPA或FDA批准的NGS产品进行检测,检测包含MSI、tTMB、免疫治疗正负向相关基因和免疫治疗超进展相关基因在内的免疫治疗相关分子标志物。【III级推荐】在条件允许的情况下,如患者有意愿获取最为全面的基因变异信息,晚期新发或术后复发的NSCLC患者,首次基因检测可以自行选择NMPA或FDA批准的CGP NGS检测产品,在全面了解肿瘤基因组信息的基础上制订一线治疗方案。【II级推荐】晚期新发或术后复发的NSCLC患者,首次基因检测组织样本不足或组织检测失败时,经NMPA或FDA批准的液体活检检测产品可作为辅助或补充。【II级推荐】对于脑转移患者(包含脑膜转移),有证据表明脑脊液ctDNA体现出比血液ctDNA更好的检测性能,在条件允许的情况下,优先使用脑脊液进行液体活检。【III级推荐】有证据表明,胸腔积液ctDNA体现出比血液ctDNA更好的检测性能,在条件允许的情况下,在胸腔积液沉渣中病理分析检出肿瘤细胞的前提下,优先使用胸腔积液进行液体活检。【III级推荐】对于靶向治疗耐药后的患者,为了更好地指导后续治疗方案的选择,建议使用NMPA或FDA批准的CGPNGS检测产品再次进行检测。【II级推荐】靶向治疗耐药后优先选择再次活检,如无法再次进行组织活检或活检组织样本不足时,可使用经NMPA或FDA批准的CGP NGS液体活检检测产品进行补充检测。【II级推荐】NSCLC的NGS检测样本的采集处理和保存应符合规范要求。未接受过靶向/免疫药物治疗的患者,NGS检测应首选经病理评估的组织样本。接受过靶向/免疫药物治疗的患者,应尽可能使用治疗后的样本。【I级推荐】NSCLC的NGS检测流程应符合规范要求,配备完善的标准操作流程和独立的质量控制程序。【I级推荐】二代测序技术为NSCLC患者带来了更多更全面的基因突变信息,倡导各单位组建NSCLC-MTB,以正确解读基因检测的结果,制定个体化临床治疗决策。【II级推荐】二代测序技术的全面应用,将为NSCLC患者个体化临床诊治奠定基础。未来可以通过对患者临床诊疗信息、基因检测结果、后续治疗方案的全程管理,建立NSCLC患者个体化精准治疗平台,同时积累真实世界数据,不断丰富和完善我国NSCLC患者的个体化诊疗全景图。此外,重视肿瘤临床医师与病理科医生、分子生物学及生物信息学专家的合作,构建分子肿瘤专家委员会的新型多学科诊疗模式也是肿瘤临床和研究的重要发展方向。
中国临床肿瘤学会非小细胞肺癌专家委员会. 二代测序技术在NSCLC中的临床应用中国专家共识(2020版). 中国肺癌杂志, 2020, 23(9): 741-761.