Nat Biotechnol:科学家发现能准确高效进行单细胞转录组特性分析的最佳技术—Quartz-seq2

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为了确保单细胞RNA测序能够使用最好的方法,日前研究人员对13种方法进行了基准性的测试,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中,来自西班牙的科学家们通过研究发现,日本理化所开发的Quartz-seq2方法或许是进行单细胞RNA测序的最佳手段。此前,用于基因组分析的方法缺乏一定的基准,这就会在后来的分析过程中产生许多问题,由于使用不同方法的研究小组有着不同的标准,因此其所得到的结果也不尽相同;基于这一点,许多从事单细胞RNA分析的研究人员联合起来评估不同的手段,从而筛选出具有良好可重复性的方法。

单细胞RNA测序被视为基因组研究中下一个重大的计划,最初,以人类基因组计划为例的基因组研究试图确定在任何有机体所有细胞中所发现的DNA序列,但让事情变得复杂的是,有机体的细胞共享着相同的DNA代码,实际上,这些细胞在表型上是不同的,因为基于表观遗传学因素,不同的基因会表达或不进行表达。而且启动子和增强子的遗传区域在表达上也存在巨大差异,其并不直接编码蛋白,但却会对其它遗传区域产生影响。因此,理解单个细胞的遗传组成或许有望帮助研究者确定单个细胞在诸如癌症等疾病中是如何表现出差异的,以及其在发育过程中改变的机制,目前正在参与人类细胞图谱绘制的科学家们就正在开发一种针对不同细胞类型的全面基因表达图谱。



(责任编辑:labwebx)