组学(Omics)主要包括基因组学(Genomics)、蛋白组学(Proteinomics)、代谢组学(Metabolomics)、转录组学(Transcriptomics)、脂类组学(lipidomics)、免疫组学(Immunomics)、糖组学(Glycomics)和 RNA组学(RNomics)学等, 是随着分子生物学和信息科学不断进步而发展起来的一门新兴学科,主要从整体、系统的角度出发进行人类组织、细胞的结构、基因、蛋白及其分子间相互作用的研究,并通过对人体组织器官功能和代谢状态的系统分析,为探索人类疾病的发病机制、诊断治疗提供新思路。在具体方法方面,组学生物信息需首先获得相关组学数据(包括已有芯片数据和高通量测序数据),随后利用生物信息学(Bioinformatics)手段与方法,结合患者个体数据,为准确诊断和疾病治疗提供有力保障。
随着人类基因组计划的完成,精准医学、个体化医疗概念相继提出。利用高通量测序与芯片技术实现复杂疾病、个体特异疾病的诊断和治疗,是临床诊断发展的方向和目标。了解各组学原理、技术,结合组学分析报告进行疾病的诊断,将是临床检验专业学生所必备技能。目前,各种组学技术迅猛发展,临床海量数据已逐步累积,如何有效进行数据的存储、管理、分析,如何利用组学技术准确解读疾病发生机理,如何将病人个体化数据与已有数据结合进行诊断疾病、判断病情,成为组学数据研究的焦点。
本课程是医学检验专业、医学生物技术及相关专业的选修课,主要目标以学生入门引导为主,使之掌握各组学技术的基本原理(包括优劣)、基本研究内容、基本分析流程及相关分析方法和工具软件,基本形成基于组学生物信息学的临床诊断难题与科研问题的思维模式,具备判断、解释组学报告的能力。
组学技术与生物信息学(下简称“组学生物信息”)是医学检验专业、医学生物技术及相关专业的选修课,主要目标以入门引导为主,使之掌握各组学技术的基本原理(包括优劣)、基本研究内容、基本分析流程及相关分析方法和工具软件,基本形成基于组学生物信息学的临床诊断难题与科研问题的思维模式,具备判断、解释组学报告的能力。
本课程由五章组成,内容包括组学生物信息概述、基因组数据与分析、转录组数据与分析、蛋白组数据与分析以及代谢组数据与分析。
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第一章 概论
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第二章 基因组数据与分析
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第三章 转录组数据与分析
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第四章 蛋白组数据与分析
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第五章 代谢组数据与分析